Los materiales a tratar en un Hidrogenador Parr se sellan en una botella de reacción con un catalizador y conectado a un depósito de hidrógeno. El aire es eliminado, evacuando la botella por lavado o con hidrógeno. Entonces se aplica presión desde el depósito y la botella se agita vigorosamente para iniciar la reacción. Si es necesario, la botella se puede calentar o enfriar durante este proceso. Cuando la reacción alcanza el punto deseado, el agitador se detiene, la botella se ventila y el producto y el catalizador se recuperan.